大运河博物馆是一个圆柱形的建筑，半径在四十米左右，一层的面积大约在五千多平方米，地下两层，地上四层。
进入到博物馆大门之后，首先就是一个就是一个长约三十米，宽约十五米的大房间，这是博物馆的隔离区。
在这个隔离区的两侧，是楼梯间和电梯间，不过这里的楼梯间和电梯只能下不能上，有专人看守，和隔离区之间也有两道全封闭的不锈钢栅栏相隔。在一层大厅正对大门的另一端，也有楼梯间和电梯间，游客游览完一楼之后，从那边的楼梯间上楼或者乘坐电梯上楼继续游览，一旦游览完毕，就可以从隔离区的这两个楼梯间下楼，然后直接从出口出去。
在这个隔离区内靠墙位置有十个大型的密码储物柜，按照规定，游客进入到博物馆时是不可以携带包裹之类的东西，这些东西需要存放在这些储物柜中。
在隔离区的另外一边，是十五个安检门，在每个安检门的内外两侧，则各有一名身穿制服的保安手持金属探测器进行检测。
想要进入到博物馆的游客，必须要从这十五个安检门中的一个通过，然后经过保安的检测之后，才可以进入到博物馆进行参观。
从隔离区的安检门出去之后，就是一面巨大的迎宾墙，上面写着“大运河博物馆欢饮您”几个金色大字。在这面迎宾墙的前方是一个半径大约在五米左右的隔离区域内，这片区域的外围用不锈钢栅栏隔开，不锈钢栅栏里面站立着四个荷枪实弹的武警战士还有两大两小四个防弹玻璃柜。
其中那两个分列在两侧的大防弹玻璃柜中，有一金一银两座“金山银山”！
这两座金山银山就是杨靖用沐天波宝藏中的那些金元宝和银元宝垒砌来的，呈金字塔形，高大约有两米，在射灯的照射下，散发着金银独有的动人光彩。
而在这两座金银山之间的那两个小不少的防弹玻璃柜里面，则摆放着一方玉玺和四个头盖骨化石。
那四位武警保护的并不是那两座金山银山，而是这方传国玉玺和北/京/人头盖骨花石。
迎宾墙前面的这块隔离区域面积足够大，而且这里是博物馆的进口，所以一进来的游客，第一眼就能看到这两座金银山以及那方传国玉玺和那四个摆放在一起的北/京/人头盖骨花石。
光是一进门的这两座金山银山就足以让人惊叹了，这可是正儿八经的明朝金元宝和银元宝，金银本身的价值先不说，光是这份沉甸甸的历史，就足以让这两座金山银山价值大增。
至于传国玉玺和北/京/人头盖骨花石，那就更不用说了，那才是最吸引人的镇国之宝。
所以，哪怕迎宾墙外面到安检门之间的这片区域面积足够大，可这里也成了游客最多的地方。要不是有数十个保安维持秩序，这里恐怕早就已经乱了套。
不过这里有足够的保安，在保安的引导下，众多恋恋不舍的游客只能慢慢的向别的展厅分流。
整个大运河博物馆地面四层一共被分为了十个展厅，分别是西方艺术品厅、杂项厅、玉石厅、家具厅、碑刻厅、书法厅、古画厅、陶瓷厅、文献厅、金银厅。
一楼因为牵扯到入口和出口以及办公区域，所以在一楼仅仅只有一个西方艺术品展厅，而其他的九座展厅则分布在二楼、三楼以及四楼，一层楼三坐在展厅。
西方艺术品厅不言而喻，自然摆放的是杨靖从国外几个宝藏中获取的宝贝，还有老迈克这些年来从全世界各地买来的古董艺术品。
这座展厅之所以安排在一楼，一个是因为展品的数量比较多，再一个就是这个展厅中展出的展品就没有一件不是精品的。
三大青铜雕塑的地位自然不言而喻；达芬奇、拉斐尔、塞尚、安格尔、鲁斯本、伦勃朗、莫奈、列宾..