当鲁鲁修再次回到黑色骑士团时，心中充斥的唯有仇恨，他要向背叛自己的人复仇，向朱雀、查尔斯、修奈泽尔……
鲁鲁修手中拥有集合了全世界力量的Knightmare，修奈泽尔手中拥有巨量军队，还有威慑世界的武器——芙蕾雅。
混乱的战争在仇恨升华中全面打响，卡莲也被救出来，为了保护zero，卡莲驾驶着红莲圣天八极式，在正面战场获得优势，救下陷入危及的zero。
朱雀为了阻止这场战争，携带着芙蕾雅的发射器冲向鲁鲁修，准备以这个武器，威慑两方军队，挽救战场范围内上千万普通民众。
生死攸关之际，本打算用于威慑的武器芙蕾雅，却在鲁鲁修的geass“不能死”作用下，被控制的朱雀按下发射按钮。
粉红色的光芒掩盖了战场上的一切，没有巨大的声音，人们就像失聪了一样，在悲哀的死之奏乐中，呆呆地“欣赏”死亡。
待一切平息，芙蕾雅波及范围内的一切化为废墟，只留下一个半球形的大坑，战争双方各居一边，惊魂不定地看着那巨大的弹坑，芙蕾雅巨大的威力，深深烙印在每一个人心中。
但战场中有个人并未注意这些，因为他在乎的是公馆里的娜娜莉。
这场战争的起因，自私点说，其实就是鲁鲁修为了夺回妹妹。而芙蕾雅爆炸点正下方，便是娜娜莉所在的公馆。
娜娜莉的“死亡”令鲁鲁修悲痛欲绝，政事方面也出现漏洞。修奈泽尔利用这个机会，亲自来到黑色骑士团谈判。
Zero的真实身份是个定时炸弹，在这关键时刻，鲁鲁修的行为就如同走钢丝，布里塔尼亚继承人身份一旦曝光，绝对能引发巨大海啸。修奈泽尔这次来，目的就是提前引爆这场大洪水。
在黑色骑士团内部发生裂隙，出现不同意见时刻，修奈泽尔与黑色骑士团谈判，并在“不经意”间透露出zero的真实身份，布里塔尼亚第十一皇子，鲁鲁修?vi?布里塔尼亚，同时又透露geass的消息，往鲁鲁修身上泼脏水。
鲁鲁修的存在，是所有想往上走的政治家们地阻碍，而在芙蕾雅威慑下，不少政客觉得这场战争可能就要到此为止了。于是，为了战后利益，为了满足欲望，他们故意放出风声，并纵容谣言四起。
不少人被谣言煽动，虽然有人认为这是布里塔尼亚人的阴谋，但大多数人都觉得这是真的。骑士团内部因此事，分裂现象愈发严重。
然而当沉浸在失去亲人的痛苦中，许久不问政事的鲁鲁修被黑色骑士团和修奈泽尔的埋伏包围时，他才从悲伤中醒悟过来，可一切都太迟了。
曾经并肩作战的友谊，追随身边宣誓效忠的信任，共同的理想与目标，在权与利的面前竟然如此廉价，扇要、藤堂和布里塔尼亚的圆桌骑士……
国破家亡的仇恨，数以千万记的人命，仅凭一番话语便有合作可能，而合作的基础竟是建立在杀死领导人的基础上，简直可笑至极，但鲁鲁修笑不出，因为这件事给他上了最后一课——人心。
人心鳝变，非是欺骗与背叛，而是有目的的选择。
人因欲望而活。
有的人喜欢权利，所以努力攀爬；有的人喜欢财富，所以努力赚钱……
不论他们的欲望是什么，根源来自何方，现在，矛头一同都指向zero。
现在的情况，已经不是可以解决的事了。关键在于geass这种控制人心的力量，是所有谋求利益之人渴望又害怕的东西，如果不能掌握在自己手里，那么就将其毁灭。
因背叛欺瞒而愤怒的平凡者、因渴望权势而下绊的投